(二)民國78年4月7日董事會經花蓮地方法院健民卯字第7235號函核准登記為為財團法人。

(三)民國78年6月12日奉教育部台(七八)技字第27594號函核准立案，並核定設置二年制日間部護理科二班，參加二年制日部護理科聯合招生考試。並由財團法人慈濟慈善事業基金會提供本校學生公費就讀制度，凡申請者一律由基金會代墊學雜費、伙食費、住宿費及每月三千元零用金，有公費一年服務一年的規定。次年改參加四技二專工業護理醫藥海事類日間部聯招護理類考試。

(四)民國79年5月18日奉教育部台(七九)技字第22777號函核准增設五年制日間部護理助產科二班，參加北區五年制專科學校聯合招生考試。財團法人慈濟慈善事業基金會除提供公費獎學金外，另開始提供清寒學生獎助學金，獎助內容與公費生同，但無服務義務。

(五)民國79年7月5日奉教育部台(七九)技字第31626號函自第二屆起改五年制護理助產科為五年制護理科。

(六)民國81年3月6日奉教育部台(八一)技字第11461號函核准二年制護理科乙類在職班改為二年制夜間部，並分設普通班一班及在職班一班，參加花蓮區專科學校二年制夜間部聯合招生考試。

(七)民國83年2月18日奉教育部台(八三)技字第008517號函核准增設五年制護理科一班，合計三班。

(八)民國84年4月17日奉教育部台(八四)技字第017307號函核准增設二年制復健科二班參加四技二專工業護理醫藥海事類科日間部聯招護理類考試；幼兒保育科二班、醫務管理科一班，參加北區四技二專商業幼保美容類科日間部聯招幼保類、商業類考試。同年再增加五年制護理科一班，合計四班。

(九)民國84年第1屆五年制日間部護理科學生畢業。

(十)民國84年5月7日奉教育部台(八五)技(二)字第85507253號函核准本校85學年度獨立招收五年制護理科原住民學生一班，由本校成立慈濟護專五年制護理科原住民學生招生委員會辦理招生。

(十一)民國85年5月17日奉教育部台(八五)技(二)字第85039495號函核准本校85學年度增設二年制日間部放射技術科一班，參加四技二專工業護理醫藥海事類科日間部聯招電子類考試。

(十二)民國86年2月14日奉教育部台(八六)技(二)字第86008698號函核准本校86學年度獨立招收復健科應屆畢結業生學業優良保送甄試入學復健科學生三十名。

(十三)民國86年第1屆二年制日間部復健科、幼兒保育科、醫務管理科學生畢業。

(十四)民國86年1月19日本校附設實驗托兒所成立，開始辦理幼兒冬令營活動，86年2月24日正式開學招收三至六歲幼兒三班，86年3月22日舉行托兒所創所始業典禮。

(十五)民國86年8月11日奉花蓮縣政(八六)府社福字第93077號函核准立案，並核准收托三班九十名幼生。

(十六)民國86年6月6日第1屆二年制日間部放射技術科學生畢業。

(十七)87學年度本校二年制夜間部護理科在職班參加花蓮區試辦夜間部申請入學招生。

(十八)87學年度本校二年制夜間部護理科普通班參加四技二專日間部工業醫護海事等類科聯合招生。

(十九)87學年度本校五年制護理科提供一百名參加北區五專聯合推薦甄選入學招生；另一百名參加北區五年制專科學校聯合招生考試。

(二十)民國87年12月21日台(八七)技(二)字第87144444號核准本校復健科更名為物理治療科。

(廿一)民國88年4月23日奉教育部台(八八)技(二)字第88043936號函核定本校自88年8月1日起改制為「慈濟技術學院」。改制後專科部二年制日間部幼兒保育科減一班，放射技術科、物理治療科（原復健科）停招，專科部二年制夜間部護理科普通班停招。增設技術學院二年制日間部物理治療系、放射技術系、醫務管理系、幼兒保育系各一班。

(廿二)民國88年12月15日奉教育部台(八八)技(二)字第88157760號函核定本校自89學年度增設四年制日間部物理治療系、放射技術系、醫務管理系、幼兒保育系、會計系；二年制日間部醫務管理科停招，另增設二年制夜間部幼兒保育科及二技醫務管理系在職班。

(廿三)民國89年5月29日奉教育部台(八九)技(二)字第89060877號函核定本校自90學年度增設二年制日間部護理系、二年制進修部護理系在職班、在職專班；另二年制日間部護理科、幼兒保育科、二年制夜間部護理科及二年制日間部物理治療系、放射技術系停招。

(廿四)民國91年2月21日奉教育部台(九一)技(二)字第91023435號函核定本校自91學年度停招二年制日間部醫務管理系、夜間部幼兒保育科，另五專護理科減少一班，招生四班。

(廿五)民國91年7月11日奉教育部台(九一)技(二)字第91102559號函核定本校自92學年度停招二年制日間部幼兒保育系。

(廿六)民國93年增設二年制進修部幼兒保育系在職班，並停招四年制日間部幼兒保育系。

(廿七)民國92年9月9日奉教育部台技(二)字第0920035139號函核定本校93學年度四年制日間部會計系更名為會計資訊系；四年制日間部幼兒保育系、二年制進修部醫務管理系在職專班停招。

(廿八)民國93年9月27日奉教育部台技(二)字第0930120255號函核定本校94學年度四年制日間部放射技術系增加一班，合計二班；二年制進修部幼兒保育系在職班停招。

(廿九)民國94年11月9日奉教育部台技(二)字第0940155940號函核定本校95學年度增設四年制資訊工程系一班、二年制護理系一班，合計二班。

(三十)民國96年停辦幼兒保育系四年制日間部及進修部二年制在職班。

(三十一)民國96年5月9日奉教育部台技(二)字第0960067601A號函核定本校97學年度增設放射醫學科學研究所碩士班，招生6名。

(三十二)民國96年四年制放射技術系奉准減招一班，合計招收一班；四年制醫務管理系奉准增一班，合計二班。

(三十三)民國96年2月6日奉教育部台技(一)字第0960020729號函核定97學年度起五年制護理科原住民專班改為履約公費班。

(三十四)民國97年9月11日奉教育部台技(二)字第0970179202號函核定98學年度二年制護理系每年招收50名履約獎助生。

(三十五)民國97年12月17日奉教育部台技(二)字第0970251905號函核定98學年度停招四年制物理治療系，四年制資訊工程系增招一班，合計二班。

(三十六)民國98年3月17日奉教育部台社(一)字第0980038254號函同意本校於98學年度以產學合作式回流教育班方式附設進修學院。

(三十七)民國98年7月23日奉教育部台技(二)字第0980126278號函同意本校於99學年度四年制醫務管理系增招15名，共95名。

(三十八)民國98年12月11日奉教育部台高(四)字第0980216444號函同意財團法人慈濟大學、財團法人慈濟技術學院、財團法人臺南市私立慈濟高級中學及財團法人臺南市私立慈濟國民小學等4校法人合併為「慈濟學校財團法人」。

(三十九)民國99年5月21日奉教育部台技(二)字第0990085013E號函同意本校於100學年度五年制護理科原住民專班增招25名，共75名。

(四十)民國99年12月30日奉教育部台技(二)字第0990223750號函同意本校於100學年度五年制護理科原住民專班再增招25名，共100名。

(四十一)民國100年6月13日奉教育部台技(二)字第1000098173A號回函同意本校於101學年度「放射技術系」改名為「醫學影像暨放射科學系」，另放射醫學科學研究所碩士班再增招2名，共8名。

(四十二)民國101年7月4日奉教育部臺技(二)字第1010124001A號回函同意本校於102學年度二年制護理系增招50名，共145名。